Ważnym działem etykiety żeglarskiej jest etykieta flagowa. Stanowi zbiór norm odwołujących się zarówno do zwyczajów i tradycji, jak i obowiązujących przepisów resortowych, państwowych oraz międzynarodowych regulujących sposób podnoszenia i noszenia przez jachty flag, bander i proporców.
Banderę harcerską podnosi się na jachtach w kampanii w żegludze po wodach śródlądowych, wewnętrznych oraz w portach polskich. W porcie i na kotwicy banderę nosi się od godz. 8.00 do momentu zachodu słońca, natomiast w morzu (w drodze) niezależnie od pory dnia. W rejsach kilkugodzinnych banderę podnosi się tylko w czasie żeglugi i podczas przebywania załogi na jachcie.
W rejsach pełnomorskich i w obcych portach nosi się banderę PZŻ.
Na jachtach wielomasztowych banderę nosi się w morzu (w drodze) na topie lub piku gafla tylnego masztu, natomiast w porcie i na kotwicy - na flagsztoku.
Przeniesienie bandery z masztu na flagsztok powinno nastąpić natychmiast po zacumowaniu lub zakotwiczeniu i odwrotnie przed samym odejściem od nabrzeża lub z kotwicy.
Na jachtach jednomasztowych i motorowych (w drodze) banderę podnosi się na flagsztoku lub piku gafla.
Banderę harcerską podnosi się na masztach ośrodków, stanic, przystani i obozów o godz. 8.00 i opuszcza się o zachodzie słońca. Banderę podnosi się na gaflu lub na topie masztu.
Rozmiar bandery musi być dostosowany do wielkości jachtu lub masztu na obozie:
banderę wielką podnosi się w święta i podczas uroczystości na jachcie flagowym ZHP i na masztach ośrodków morskich oraz na imprezach centralnych,
banderę dużą podnosi się na jachcie flagowym ZHP, w ośrodkach morskich oraz w ośrodkach śródlądowych, stanicach, przystaniach i obozach,
banderę zwykłą i małą podnosi się na jachtach i masztach obozowych w zależności od ich wielkości.
Banderę podnosi się uroczyście na zbiórce załogi lub uczestników obozu na komendę "Baczność, banderę podnieść". W momencie podnoszenia wybija się dzwonem cztery szklanki. Banderę podnosi się wolno i miarowo. Kadra salutuje. Kiedy bandera jest na miejscu, pada komenda "Spocznij". Komendę "baczność" (sygnał --) i "spocznij" (sygnał ••) można wydawać gwizdkiem.
Opuszczenie bandery odbywa się bez zbiórki, na komendę "Baczność, banderę opuść". Komenda dotyczy wszystkich znajdujących się w pobliżu.
W razie ogłoszenia żałoby na jachcie, w porcie, w ośrodku wodnym lub na obozie, bandera zostaje opuszczona do połowy
Jeżeli żałoba trwa dłuższy czas, wówczas przy podnoszeniu bandery podnosi się ją najpierw do szczytu i dopiero wtedy opuszcza do połowy. Podobnie postępuje się przy opuszczaniu bandery. Taka sama procedura obowiązuje przy salutowaniu banderą.
Jacht w drodze nosi żałobę jedynie w przypadku, gdy na jego pokładzie znajdują się zwłoki.
Proporzec harcerski nosi się na topie grotmasztu jachtu w kampanii cały czas. Rozmiar proporca musi być dostosowany do wielkości jachtu.
Proporzec harcerski podnosi się pod salingiem na nieharcerskim jachcie wyczarterowanym przez załogę harcerską.
Proporce funkcyjne podnosi się pod prawym salingiem jachtu na maszcie, w ośrodku, przystani lub na obozie w czasie przebywania tam osoby, której proporzec przysługuje.
Jednocześnie można podnosić tylko jeden proporzec funkcyjny według starszeństwa.
Proporzec komodora flotylli podnosi się pod salingiem jachtu, na którym przebywa lub którym dowodzi komodor.
Salut banderą polega na opuszczeniu jej do połowy masztu lub flagsztoku i podniesieniu jej "do miejsca", ale dopiero wtedy, gdy salutowany odpowie opuszczeniem i natychmiastowym podniesieniem swojej bandery.
Na małym jachcie można salutować przez wyciągnięcie flagsztoku i trzymanie go poziomo.
Nie salutuje się z odległości większej niż 0,5 Mm.
Przy spotkaniu z zespołem okrętów, salutuje się tylko pierwszemu okrętowi z szyku.
Oddanie honoru banderą odbywa się na komendę kapitana lub oficera wachtowego: "Salut banderą"; może być wydany gwizdkiem (sygnał ----)
Z okazji świąt państwowych, świąt lokalnych, na prośbę władz miejscowych i innych uroczystości na jachcie podnosi się galę banderową, którą tworzą flagi MKS w kolejności AB1, CD2 itd., stawiane od dziobu poprzez topy masztów do rufy. Galę banderową stawia się tylko podczas postoju w porcie lub na kotwicy, stawiając ją i opuszczając razem z banderą.
Bandery, flagi i proporce wiąże się do flaglinki węzłem bramsztowym, tak aby nie wisiał żaden wolny koniec flaglinki. Bandera i flaga powinny być podniesione do samego szczytu, flaglinka musi być zawsze obciągnięta. Przy podnoszeniu i opuszczaniu bandera nie może dotykać pokładu.
Bandera powinna być przechowywana z należytym szacunkiem, starannie złożona, zabezpieczona przed wilgocią.